Scalda il forno ventilato a 190°.
Mescola i finocchi, le cipolle, l'olio, sale e pepe in una teglia capiente e infornali per circa 20 minuti.
Adagia il salmone sulle verdure.
Mescola il prezzemolo, i capperi, la buccia di limone in una ciotola. Distribuiscili poi sui filetti di salmone e prosegui la cottura in forno per per altri 10-15 minuti.
Servi il salmone al forno con i finocchi ben caldo.